氨基酸是构成蛋白质的基本单位，而蛋白质是由氨基酸通过肽键连接而成的大分子。蛋白短肽是介于氨基酸和完整蛋白质之间的中间产物，由两个或多个氨基酸通过肽键连接而成，但长度较短，通常由2到50个氨基酸残基组成。

氨基酸和蛋白短肽的关系可以从以下几个方面来理解：

1.结构关系：

氨基酸：是蛋白质的基本构成单元，每个氨基酸分子至少包含一个氨基和一个羧基，以及一个特定的侧链。

蛋白短肽：由两个或多个氨基酸通过脱水缩合反应连接而成，每个氨基酸之间通过肽键连接。

2. 功能关系：

氨基酸：单独的氨基酸通常不具有生物活性，它们的主要功能是作为构建蛋白质的“砖块”。

蛋白短肽：一些短肽具有一定的生物活性，可以作为信号分子、激素或酶的抑制剂等，参与调节生物体内的多种生理过程。

3. 代谢关系：

氨基酸：在蛋白质消化过程中，蛋白质首先被分解成多肽，然后进一步分解成单个氨基酸，这些氨基酸可以被吸收进入血液循环，用于合成新的蛋白质或作为能量来源。

蛋白短肽：在消化过程中，蛋白质分解产生的短肽可以被进一步分解成氨基酸，或者在某些情况下，短肽可以直接被吸收并发挥特定的生理作用。

4. 营养关系：

氨基酸：人体不能合成所有必需氨基酸，这些必需氨基酸必须通过饮食摄入。

蛋白短肽：一些短肽可以作为营养补充剂，特别是对于那些消化功能受限或需要特殊营养支持的人群。

5. 生物合成：

氨基酸：在细胞内，氨基酸通过转录和翻译过程合成蛋白质。

蛋白短肽：在蛋白质合成过程中，氨基酸首先连接成多肽链，然后折叠成具有特定功能的蛋白质。